超声波清洗机在运作过程中会产生一些副产品，主要包括：

废水废液、部分臭氧气体和热量。其中被洗的物体由于是浸泡式或刷浸式的.会在水里反复搅动摩擦,导致水中含有许多细小颗粒以及残留物;另外水会被污染浑浊需要定期排放出去也就是所说的"废水",这些液体中含有微小的固体废物残渣；同时设备运行也需要添加一定的纯净水和润滑剂等保护机器的正常使用而产生相应的消耗品垃圾污水等等 。此外还有一部分的气体产物为臭氧气泡混合于空气中对人体健康无害但需要注意安全防护措施以防止意外伤害的产生 ；就是少量的热能伴随着设备的运转过程散热系统也会持续将机体多余能量释放到外界环境当中去以确保正常的工作温度范围对于整体的环境影响而言可以忽略不计。